药物流产后全身发热可能与术后感染、内分泌失调有关。

1.术后感染：药物流产后机体免疫力下降，若未注意个人卫生，可能导致病原体侵入，引发局部或全身感染，从而出现发热的情况；

2.内分泌失调：药物流产后体内激素水平发生波动，可能导致内分泌失调，引起自主神经功能紊乱，进一步诱发发热的症状。

如果伴有明显的腹痛、阴道出血量多于月经量等情况，则可能是流产不全引起的。此时应尽快就医完善超声检查以确定宫内残留物情况，并接受适当的治疗措施。

在药物流产过程中以及之后，应注意观察身体变化，特别是是否有持续高热或其他不适症状。建议患者定期复查，监测恢复过程中的任何异常情况。