肾穿刺活体组织检查后疼痛，可能是由于肾包膜受损、操作过程中对皮肤黏膜造成损伤引起，也可能是由于感染、穿刺部位出血等原因导致，建议患者明确诊断后再进行治疗。

1、肾包膜受损：肾穿刺活体组织检查是一种有创检查，在穿刺过程中会对肾包膜造成一定的刺激，操作结束后可能会引起腰痛、腹痛等症状，疼痛通常不会特别剧烈，大部分患者可以耐受，通常不需要特殊治疗。

2、操作过程中对皮肤黏膜造成损伤：在穿刺的过程中，如果操作人员操作不当，对皮肤黏膜造成了一定的损伤，可能会导致患者腰部疼痛，症状较轻时通常不需要特殊治疗，若疼痛较为剧烈，则可以遵医嘱使用塞来昔布胶囊等药物进行止痛治疗。

3、感染：如果在做完肾穿刺活体组织检查后没有做好局部护理工作，可能会导致创面受到病原菌感染，在炎症的刺激下可能会引起腰痛等症状，此时需要遵医嘱使用头孢克肟胶囊、甲硝唑片等药物进行抗感染治疗。

4、穿刺部位出血：做完肾穿刺活体组织检查后若发现穿刺部位出血，局部可有血肿形成，就会引起疼痛的症状，此时可以使用肾石通颗粒等药物治疗，同时还要注意多休息。

除上述原因外，患者出现此情况还可能是肾脏疾病加重导致，可到肾内科就诊，完善肾脏彩超、CT等检查明确情况。