治疗肾萎缩需要中西医结合的方法，可遵医嘱服用百令胶囊、金水宝胶囊等中成药以及呋塞米片、氢氯噻嗪片等西药进行治疗。
上述药物均需经肾脏代谢，因此对肾功能有一定的影响，但不会加剧肾萎缩的程度。百令胶囊、金水宝胶囊等中成药具有补肺益肾的作用，适用于缓解因肾虚引起的症状；呋塞米片、氢氯噻嗪片则可用于水肿性疾病，减轻心脏负荷。
针对肾萎缩的药物治疗需谨慎选择，可能包括他克莫司胶囊、环磷酰胺片等免疫抑制剂。这些药物能减缓病情进展，但须在医师指导下使用。
患者应定期监测肾功能指标，避免过度劳累及摄入可能加重肾脏负担的药物或食物。
