父亲有多囊肾，孩子不一定都会患病。

虽然多囊肾是常染色体显性遗传疾病，意味着只要一个基因突变就足以导致患病，但如果父亲携带的是隐性基因，则不会表现出症状，也不会将此基因传给孩子。

如果母亲也患有多囊肾，则子女患有多囊肾的风险会显著增加。这是因为多囊肾属于常染色体显性遗传病，父母双方都可能传递致病基因给子女。

对于存在家族史的家庭来说，定期体检以及监测肾脏功能是非常必要的。同时，避免高盐饮食、限制饮酒量也是预防多囊肾并发症的有效措施。