经皮肾手术拔J管后小便刺痛可能是术后并发症引起的，如尿路感染、血尿等。

术后尿道黏膜受到创伤，易发生细菌感染，导致尿路感染的发生，出现尿频、尿急、尿痛等症状，从而引发小便刺痛的现象；若术后未做好护理工作，可能会导致尿道出血，血液混入尿液中形成血尿，此时可表现为小便刺痛伴有血尿的症状。

如果患者存在尿道狭窄或结石残留等情况时，在拔除J管后可能会刺激尿道，引起排尿困难、疼痛等症状。这些情况可能需要进一步的治疗，如尿道扩张术或碎石术。

在术后恢复期间，患者应保持充足的水分摄入，以促进尿液排出和伤口愈合。同时，注意观察是否有发热、腰痛等不适症状，并及时就医处理。