胎儿窘迫可能伴有轻度至重度的后遗症，取决于胎儿受损的程度以及是否得到及时有效的治疗。

胎儿窘迫期间，由于缺氧，大脑皮层下血管收缩，使脑血流量减少，脑细胞代谢障碍，从而出现暂时性的功能抑制现象。若缺氧持续存在，会导致神经细胞坏死，造成不可逆的损害，留下不同程度的后遗症。

胎儿窘迫可能导致长期脑损伤、肺发育不全等严重后遗症。这些后遗症与胎儿在宫内受到的压力或缺氧有关。

围产期保健中应定期监测胎儿状况，以早期发现并预防胎儿窘迫的发生，降低其对胎儿的潜在影响。