经皮肾碎石后小便刺痛可能是术后并发症引起的，如感染、出血等。

经皮肾碎石术是在X线监控下利用液电式碎石机将结石击碎成数毫米至数十毫米大小不等的小块，然后通过尿液排出体外。手术中使用的器械可能会对尿路黏膜造成一定的损伤，导致术后短期内出现小便刺痛的症状。此外，术后患者免疫力下降，易发生细菌感染，进一步加重了尿路刺激症状。

若疼痛持续时间较长或伴有血尿等症状，则需考虑是否为术后并发感染或出血等情况。此时应尽快就医以评估病情严重程度，并接受相应治疗措施。

在经皮肾碎石术后，患者应注意观察排尿时是否有血尿现象以及是否存在发热等症状。如果发现异常应及时告知医生并配合检查处理。