嘴唇疱疹和生殖器疱疹是两种不同的疾病，分别由HSV-1和HSV-2感染引起。

嘴唇疱疹多由HSV-1引起，可通过唾液飞沫、密切接触传播，常见于口周区域；而生殖器疱疹则主要由HSV-2所致，经由性行为传播，在外阴、肛门等处形成水疱。两者虽有相似的症状，如疼痛、瘙痒及溃疡，但由不同类型的单纯疱疹病毒诱发，需依据特定的实验室检测进行区分诊断。

嘴唇疱疹还应与其他可能引起唇部水疱的疾病相鉴别，例如口腔带状疱疹、药物过敏反应或大疱性类天疱疮等。

针对嘴唇疱疹和生殖器疱疹的治疗有所不同，因此在确诊前应避免使用未经医生指导的任何药物以减少耐药性的产生。此外，患者应保持良好的个人卫生习惯，避免共用牙刷、毛巾等个人用品，以降低交叉感染的风险。