打完肾结石后小便会刺痛，可能是由于正常现象、损伤、感染、碎石治疗失败等原因导致。建议患者及时就医，通过B超、CT等相关检查，明确具体原因后，在医生指导下进行针对性治疗。

1、正常现象：若患者体内的结石体积较小，经输尿管排出时，可能会对输尿管壁造成刺激，从而引起小便刺痛的症状。但此时疼痛通常较轻，无其他不适症状，属于正常现象，一般无需进行特殊处理;

2、损伤：若患者在打肾结石的过程中，由于医生操作不当，导致输尿管损伤时，可能会引起肾脏小便时刺痛。此时建议患者注意休息，必要时可遵医嘱口服头孢克肟片、阿莫西林胶囊等药物预防感染;

3、感染：若患者在打完肾结石后未注意局部卫生，可能会导致细菌等病原体侵入肾脏，引起肾脏感染的情况，由于炎症刺激，可能会导致肾脏小便时刺痛的症状，同时可伴有尿急、尿频等表现。若为感染引起时，建议患者注意局部卫生，并可遵医嘱服用阿奇霉素片、左氧氟沙星片等药物进行治疗;

4、碎石治疗失败：若患者在打完肾结石后，结石并未排出体外，而是存在部分残留，此时由于残留的结石会对周围组织造成刺激，从而可能导致小便刺痛的症状。建议患者及时前往医院再次进行检查，若明确结石仍存在，此时需要通过再次手术将结石取出。