男性尿道疼痛及小便结束时的刺痛可能源于尿道炎。

尿道炎是由各种病原体引起的尿道黏膜炎症，可导致尿道充血水肿，当尿液流经受损的尿道时会引起疼痛感，而在排尿结束时，剩余尿液中的刺激性物质会进一步刺激受损的尿道黏膜，从而引发刺痛感。

此外，还应考虑是否存在前列腺炎、膀胱炎等疾病，这些疾病也可能引起类似的症状。需通过实验室检查或影像学评估来确定具体病因。

在诊断明确之前，建议避免摄入可能加剧尿道刺激的食物或饮料，如咖啡和辛辣食物。同时保持充足的水分摄入，有助于促进细菌排出。