慢性肺源性心脏病患者发生呼吸衰竭时，由于存在严重的肺部疾病，会导致机体缺氧和二氧化碳潴留，影响到血液循环系统，使血液中的含氧量下降，进而引发呼吸衰竭。

此情况下，由于肺循环阻力增加，右心负荷加重，可能导致肺动脉高压，进一步发展为慢性肺源性心脏病。在呼吸衰竭时，由于肺部病变严重，肺泡通气血流比例失调，肺毛细血管床减少，弥散面积减小，以及损伤的肺组织所造成的动静脉分流，使吸进的氧不能充分进入血液，而排出的二氧化碳也不能完全呼出，导致体内缺氧和二氧化碳潴留，引起一系列生理紊乱和代谢异常，如呼吸困难、发绀、神经精神症状等，严重者可出现意识障碍、昏迷甚至死亡。

如果患者还伴有急性感染，则可能会因为炎症反应加剧而诱发或加重呼吸衰竭。

针对慢性肺源性心脏病患者的治疗应综合考虑多种因素，包括控制原发病、改善呼吸功能、预防并发症，并且需定期监测血气分析以评估病情变化。