3个月婴儿腹泻可以考虑使用蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌片、枯草杆菌二联活菌颗粒、复方嗜酸乳杆菌片、布拉氏酵母菌散等药物进行治疗。但婴儿腹泻需谨慎用药，建议在医师指导下使用，若腹泻持续或伴有其他症状，应尽快就医。
1.蒙脱石散
蒙脱石散可以用于治疗小儿腹泻。该药物能吸附消化道内的各种病毒、病菌及其产生的毒素。服用时需注意按说明书推荐剂量使用，避免过量。
2.双歧杆菌三联活菌片
双歧杆菌三联活菌片适用于肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀等症状。此药内含有的长型双歧杆菌等有益菌群可直接到达小肠和结肠，抑制致病菌过度繁殖，调节正常菌群平衡。本品应密封，在不超过30℃的干燥环境下保存。
3.枯草杆菌二联活菌颗粒
枯草杆菌二联活菌颗粒可用于改善肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀等问题。其含有多种益生菌，能够抑制有害菌的生长，恢复肠道微生态平衡。对于早产儿、新生儿以及小于六个月婴儿不宜使用。
4.复方嗜酸乳杆菌片
复方嗜酸乳杆菌片适用于因肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀等情况。本品中所含的嗜酸乳杆菌等成分可竞争性抑制病原菌的附着位置，纠正肠道菌群失调状态。本品为口服制剂，不可咀嚼或压碎，以免影响吸收效果。
5.布拉氏酵母菌散
布拉氏酵母菌散适用于由梭状芽孢杆菌感染而引起的腹泻。本品中含有活性布拉氏酵母菌，可通过促进机体分泌抑菌物质及增强巨噬细胞活性来间接发挥抗梭状芽孢杆菌的作用。若对本品过敏，则禁止使用。
针对三个月婴儿腹泻的情况，家长应在医师指导下给患儿使用非处方止泻药如蒙脱石散。同时，应注意观察患儿的尿量和精神状态，确保充足的水分摄入以防止电解质紊乱。
