小肠手术后大便发黑可能是术后并发症，如术后感染、吻合口瘘等引起的。

小肠手术后，局部组织可能会因为炎症反应而充血水肿，甚至发生坏死脱落，引起出血现象，此时血液中的红细胞会破裂，释放出含铁血黄素，与粪便混合后表现为黑色。若症状持续不缓解或者伴有其他不适，应尽快返院复查，以便及时发现并处理潜在的问题。

如果患者在术后出现消化道出血的症状，且出血量较大时，也可能会导致大便颜色变深或呈黑色。

术后患者要注意观察自身症状变化，定期复查以监测病情恢复情况，并遵循医嘱调整饮食结构，避免食用辛辣刺激性食物，以免加重肠道负担，影响术后恢复。