甲硝唑主要用于治疗厌氧菌导致的尿路感染。
甲硝唑对革兰氏阴性、阳性厌氧球菌及杆菌有较强的抗菌作用，可抑制细菌脱氧核糖核酸的合成，从而干扰细菌的生长、繁殖，达到杀灭细菌的作用。而尿路感染多为革兰氏阴性菌或厌氧菌所致，所以该药适用于此类感染。但患者需要遵医嘱用药，不可自行盲目服用。
在特殊情况下，如果患者的尿路感染由产氨短杆菌等耐药菌株引起，则甲硝唑可能无效。因为甲硝唑对该类耐药菌没有较好的杀菌效果。
由于甲硝唑属于处方药物，因此使用前必须经过医生评估，并且需监测血液中酒精浓度，避免与含铝、镁、钙等金属离子的食物或药物同服，以免影响吸收。
