输卵管巧克力囊肿可能影响怀孕。

输卵管巧克力囊肿是由子宫内膜细胞种植在输卵管引起的疾病，这些异常生长的组织可能会导致输卵管功能受损，影响卵子和精子的结合及受精卵的运输，从而降低怀孕的可能性。

此外，还可能引发盆腔炎症、粘连等问题，进一步妨碍正常的生殖过程。因此，对于存在巧克力囊肿的患者，应积极寻求医生的意见，制定合适的治疗方案，减少不孕风险。

如果巧克力囊肿体积较小且无症状，则通常不会显著影响怀孕机会。但若囊肿较大或伴有疼痛等症状，则可能需要手术切除。

关注自身月经周期的变化以及腹部是否出现包块等体征，建议定期进行妇科检查以监测囊肿的发展状况。保持良好的生活习惯，避免过度劳累和精神压力，有助于减少病情的影响。