肝内胆管结石可以通过药物或手术方式治疗，多数情况下可被有效控制。
肝内胆管结石可通过药物溶石治疗如熊去氧胆酸片、牛磺熊去氧胆酸胶囊等促进结石排出；若结石体积较大或存在并发症则需通过手术如经皮经肝胆管镜取石术、腹腔镜下胆总管切开取石术等进行治疗。及时发现并采取适当措施有助于防止病情进展及减少并发症发生。
对于无症状且没有引起梗阻的微小肝内胆管结石，一般不需要特殊处理，定期复查即可。因为这些微小结石通常不会导致严重的问题，但需要密切监测其大小和位置的变化。
针对肝内胆管结石的治疗应遵循医嘱，在专业医生指导下进行药物治疗或手术干预。同时，患者应注意饮食调整，避免高脂、高胆固醇食物，以减少结石形成的风险。
