藿香正气水对于细菌感染引起的肠胃炎症有辅助治疗的作用。

藿香正气水中含有的苍术、陈皮等中药成分具有一定的抗炎作用，能够减轻由细菌感染引起的肠胃道炎症反应。

但是，对于其他病因如病毒感染所致的肠胃炎，则不适用。因此，在使用前应咨询医生以确定其是否为合适的治疗选择。

藿香正气水对于病毒性胃肠炎没有治疗效果，因为其成分为辛温解表药，而病毒性胃肠炎是由病毒感染引起，需采用抗病毒药物治疗。

在服用藿香正气水期间，应注意避免食用生冷、油腻或刺激性食物，以免影响药效发挥。此外，患者还要注意休息，保证充足睡眠，有利于促进病情恢复。