肩膀关节处转动咔咔响且伴有轻微疼痛可能源于肱二头肌长头腱与肩峰之间的摩擦。

肱二头肌长头腱与肩峰之间的摩擦会导致关节面不平整，在运动过程中产生异常声音，并引起轻微疼痛。这种情况多见于长期从事重体力劳动或高强度运动的人群，容易引发肩周炎或其他相关疾病。因此，为避免病情进一步发展，应减少肩关节负担，必要时可遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠肠溶片等药物缓解不适症状。

如果患者存在局部肌肉劳损或肌腱损伤，可能导致软组织与骨骼之间发生摩擦而出现异响。此外，还可能是由于先天性发育异常导致关节结构不稳定，从而在活动时产生异常声响。

日常生活中注意保暖，避免长时间处于潮湿寒冷环境中，以免加重不适症状。若疼痛持续或加剧，建议及时就医检查以确定具体原因并接受相应治疗。