通常甲状腺术后小便刺痛不正常，但其发生概率较小。如果在术后出现小便刺痛，可能与手术损伤、细菌感染、尿道损伤、甲状腺功能减退症等因素有关。建议及时前往医院的甲状腺外科就诊，并遵医嘱进行治疗。

1、手术损伤：在甲状腺手术过程中，可能会对尿道造成一定的损伤，其主要表现为小便刺痛。如果疼痛较为严重，可以遵医嘱服用塞来昔布胶囊，或者通过多饮水等方式进行改善;

2、细菌感染：在甲状腺手术过后，可能由于伤口护理不当，导致细菌感染，亦可出现小便刺痛的情况。这种情况下，可以在医生的建议下服用头孢克肟片、阿莫西林胶囊等药物，以改善小便刺痛的情况;

3、尿道损伤：由于甲状腺手术需要在全麻下进行，在术中可能采取气管插管等操作，可能导致尿道黏膜损伤。而且由于麻醉药物的影响，也可能导致膀胱括约肌松弛，容易引起小便刺痛和尿失禁等情况。此时可以遵医嘱服用甲硝唑片、左氧氟沙星片等药物，以预防感染。与此同时，尽量多喝水，以促进致病菌的排出;

4、甲状腺功能减退症：如果甲状腺疾病比较严重，即使进行甲状腺切除手术，但是未遵医嘱使用左甲状腺素钠片等药物进行治疗。在术后可能出现甲状腺功能减退症，容易引起小便刺痛、便秘、月经过多、闭经等症状。此时可以遵医嘱服用左甲状腺素钠片，以改善病情。