牙周炎患者可以遵医嘱服用奥美拉唑。

奥美拉唑主要通过抑制胃壁细胞H+/K+-ATP酶的活性，从而有效地抑制胃酸的生成，属于抑酸药。而抑酸后并不会对口腔内的细菌产生影响，也不会加剧炎症反应，所以可以服用。但需注意的是，如果患者对奥美拉唑过敏，则不能服用，以免引起皮疹、瘙痒等不良反应。另外，建议患者在医生指导下用药，不可私自盲目用药，以免出现不良后果。

如果患者存在幽门螺杆菌感染，可能需要联合使用抗生素治疗，以减少药物副作用和耐药性风险。

针对牙周炎的治疗，应避免食用刺激性强的食物，保持良好的口腔卫生习惯，并定期复查以便监测病情变化。对于奥美拉唑的使用，应注意可能出现的头晕、腹泻等消化系统外的不良反应，并及时向医生反馈。