新生儿感染乙型肝炎病毒后，机体免疫系统会产生针对该病毒的特异性抗体，即乙肝表面抗体。这是机体对病毒感染的一种防御反应。

因为新生儿自身的免疫系统发育还不完全，所以产生的乙肝表面抗体可能不足以长期保护其免受再次感染。因此，虽然新生儿体内存在乙肝表面抗体，但仍需密切关注并定期复查，确保其健康状况。

此外，如果新生儿在出生时已经接种过乙型肝炎疫苗，则可能出现假阳性结果，此时无需过度担心。

由于乙型肝炎是一种严重的传染病，建议家长定期监测新生儿体内的乙肝表面抗体水平，以确保其长期免疫力。必要时，可咨询医生是否需要加强疫苗接种或采取其他预防措施。