治疗阴茎萎缩短小的中药包括六味地黄丸、金匮肾气丸、五子衍宗丸、复方玄驹胶囊、锁阳补肾胶囊等。由于阴茎问题涉及泌尿系统和生殖系统健康，建议患者在使用中药前咨询专业医生以确保安全和有效。

1.六味地黄丸

六味地黄丸可用于肾阴亏损引起的阴茎萎短暂小、阳痿遗精。该药具有滋阴补肾的作用。本品宜饭前服用。服药期间忌生冷、油腻食物。

2.金匮肾气丸

金匮肾气丸对于因肾虚导致的阴茎萎短暂小也有一定效果。此药能温补肾阳和化气行水。如有肝病、高血压、心脏病、糖尿病等慢性病严重者应在医师指导下服用。

3.五子衍宗丸

五子衍宗丸适用于肾虚不育、阳痿早泄等症状。其可以补肾益精。外感发热患者不宜服用。感冒后不宜服用。

4.复方玄驹胶囊

复方玄驹胶囊可改善男性性功能障碍，如勃起功能减退、射精过快等。本品有提高机体免疫力的功效。对本品过敏者禁用。过敏体质者慎用。

5.锁阳补肾胶囊

锁阳补肾胶囊能够缓解肾阳虚引起的阴茎萎短暂小、阳痿早泄。本品有补肾壮阳的作用。服药期间应节制房事。忌食生冷、辛辣刺激之物。

以上提及的所有药物均需要经过医生辨证后使用。建议患者平时注意规律作息，适当运动，有助于增强身体素质，同时保持良好的心态，也有助于维持生殖系统的健康。