肺孢子菌肺炎可以遵医嘱使用甲氧苄啶、磺胺甲恶唑、克林霉素、阿奇霉素、环丙沙星等药物进行治疗。肺孢子菌肺炎是一种严重的肺部感染疾病，建议患者及时就医以获得适当的治疗。

1.甲氧苄啶

甲氧苄啶适用于治疗细菌感染引起的肺孢子菌肺炎。该药物能增强敏感菌的抗菌活性，从而起到抗感染的作用。

服用时需监测肾功能，避免与其他可能导致耳毒性或潜在耳毒性的药物合用。

2.磺胺甲恶唑

磺胺甲恶唑可用于治疗由耐药革兰氏阴性杆菌所致的肺孢子菌肺炎。本品可抑制细菌生长，具有广谱抗菌作用。使用时须注意过敏反应，严重者应立即停药并及时就医处理。

3.克林霉素

克林霉素对于由厌氧菌、某些革兰阳性菌和革兰阴性菌等致病菌引发的肺孢子菌肺炎有治疗效果。此药通过干扰细菌蛋白质合成来达到杀菌目的。口服剂型一般空腹服用效果更佳；静脉注射应在医院内由专业医护人员操作执行。

4.阿奇霉素

阿奇霉素为治疗非典型病原体感染如军团菌、支原体、衣原体所致的肺孢子菌肺炎的优选药物之一。其主要通过抑制细菌转肽酶系统的活性，阻碍细菌细胞壁中肽聚糖的交联形成，使细菌细胞壁稳定性遭到破坏，导致胞内渗透压升高，菌体脱水死亡。肝功能不全患者需要调整剂量以减少肝脏负担。

5.环丙沙星

环丙沙星也适用于多种细菌感染所诱发的肺孢子菌肺炎。本品属于喹诺酮类抗生素，能够有效抑制细菌DNA旋转酶的活性，阻断细菌DNA的复制过程，进而达到抗菌的目的。建议饭后服用以减少胃肠道不适的发生概率。

以上提及的所有药物均需遵医嘱合理使用。患者平时还要注意休息，保持良好的生活习惯，适当进行体育锻炼，提高身体免疫力，有利于疾病的恢复。