检查完支原体小便刺痛，可能是由于尿路感染、尿道损伤、尿路结石、前列腺炎等原因导致，需要到专业医院泌尿外科或者男科就诊咨询，完善相关检查后，根据原因进行治疗。

1、尿路感染：支原体检查主要是通过验尿或者分泌物检查的方式，判断患者是否存在支原体感染，如果在做尿检时，尿液当中存在大量的支原体，则可能会导致尿道黏膜受到刺激，从而引起小便刺痛。需要在医生指导下，合理使用一些抗感染类的药物进行治疗，比较常用的药物有阿奇霉素片、左氧氟沙星片;

2、尿道损伤：如果在做尿检时，不小心对尿道造成了损伤，在排尿的过程当中，也会对局部造成刺激，导致小便刺痛。需要多喝水，促进小便排出，可以减少尿道受到损伤;

3、尿路结石：在做尿检时，如果结石比较大，会对尿道造成堵塞，导致排尿不畅甚至无法排尿。此时需要通过激光碎石的方式将结石击碎，如果结石无法排出，可能需要通过手术的方式取石;

4、前列腺炎：前列腺炎属于一种比较常见的疾病，如果患者前列腺部位出现炎症，会导致前列腺充血、水肿，在小便的过程当中，前列腺部位充血水肿的情况会进一步加重，导致小便刺痛。需要在医生指导下使用抗生素类药物进行治疗，比较常用的药物有头孢克肟分散片、阿莫西林胶囊等。

如果患者在做完支原体检查后，出现小便刺痛的情况，建议避免擅自服用药物，以免加重病情，而是及时就诊治疗，经医生检查后积极进行治疗。