肛门指检和直肠镜的主要作用都是检测直肠内是否存在病变。这两种检查的原理是相同的，即通过肛门指检可以初步判断直肠是否存在病变，而直肠镜可以进一步判断直肠是否存在病变。这两种检查的区别主要在于检查方法、检查目的、检查前准备、检查的操作等方面。
1、检查方法：肛门指检是指医生用食指伸进患者肛门中进行触诊，大致可以感知距肛缘一指长的肛门和直肠有无病变。而直肠镜则是通过肛门镜探入直肠，可以清晰地观察直肠和大肠内部病变;
2、检查目的：肛门指检主要是对肛门及周围组织进行检查，可以初步判断是否存在肛门狭窄、痔疮、直肠息肉、肛乳头瘤等疾病。而直肠镜可以清晰地观察到直肠、全肠道病变，对于各种直肠良恶性肿瘤的诊断具有较为重要的意义;
3、检查前准备：做肛门指检需要在检查前取得病变部位的病理组织或者分泌物，建议在检查前取少量便于检查的样本，便于检查结果的准确性。而做直肠镜需要在检查前6-8小时内禁食，检查前1天建议遵医嘱口服泻剂，如聚乙二醇电解质散等，清空肠道，以便于检查;
4、检查操作：肛门指检操作较为简单，患者可以自行操作。而直肠镜操作较为复杂，需要医生对患者进行麻醉，在麻醉后进行检查，患者需要充分暴露肛门和直肠部位，才能将手指伸进肛门、直肠内，从而清晰地观察到局部病变。
