小肠破裂手术后的后遗症包括长期疼痛、消化不良等症状，需及时处理以减少影响。

小肠破裂会引起腹腔炎症反应和组织损伤，导致长期疼痛；而由于手术引起的创伤和恢复过程中的生理变化，可能会出现消化功能紊乱的情况，进而引发消化不良的症状。

如果患者在术后发现有异常症状或体征，应立即就医以便获得适当的评估和治疗。此外，定期复查以及遵循医嘱进行饮食调整和身体活动也是必不可少的环节。

术后护理过程中，密切监测任何不适症状，并按医嘱服用止痛药以减轻疼痛。同时，保持良好的营养摄入和规律的生活习惯有助于促进身体康复。