慢性肛窦炎的治疗时间因人而异，通常在数周至数月之间，其中病情严重程度是影响治疗时间的主要因素。

慢性肛窦炎是指肛窦及其周围组织的慢性炎症，通常需要及时治疗以防止病情进展。如果患者的病情较轻，仅表现为肛门不适、疼痛等症状，且及时发现并接受治疗，通常预后较好，治疗时间可能在数周内。如果患者存在免疫功能低下、肛门括约肌功能不全等情况，可能会影响肛窦炎的治疗效果和恢复时间，此时治疗时间可能会延长。

患者应定期复查，监测病情变化，以便及时发现并处理可能出现的并发症。