新生儿泌尿系感染的疗程通常在2-4周。治疗效果及感染的严重程度是影响疗程的主要因素。

新生儿泌尿系感染是指细菌侵入新生儿泌尿系统引起的炎症，需要使用抗生素治疗。新生儿泌尿系感染的疗程通常在2-4周之间，因为新生儿的免疫系统发育不完善，感染可能比较严重，需要较长的时间来控制。

如果感染伴有尿路梗阻或存在泌尿系统畸形，感染的治疗难度会增加，疗程可能会相应延长。

新生儿泌尿系感染的治疗需密切监测病情变化，及时评估治疗效果，避免耐药菌株产生。