长期分居可能会导致性功能减退。

长期分居会导致夫妻之间的情感联系减弱，缺乏正常的性生活刺激，从而影响性激素水平和神经递质平衡，进一步影响性功能。建议双方在必要时进行心理咨询或药物治疗以改善症状。

如果存在原发疾病，如心血管疾病、糖尿病等，这些疾病的病程进展可能会影响生殖系统的生理功能，进而影响性功能，此时需要考虑是否为疾病因素所致。

对于长期分居者，应关注彼此的心理健康，并定期评估性生活质量，如有不适需及时就医。