克罗恩病目前还缺乏根治性治疗方法，治疗原则为控制疾病活动，治疗并发症，预防肠道感染和维持肠道功能，医生会根据病情、预后、病变部位等因素，制定不同的治疗方案，一般包括病因治疗、药物治疗、内镜治疗和手术治疗。
1、病因治疗：克罗恩病与自身免疫因素密切相关，患者需要在医生指导下使用糖皮质激素、免疫抑制剂等药物控制疾病活动，并预防并发症的发生，如遵医嘱使用甲氨蝶呤片等。对于使用抗菌药物治疗无效的克罗恩病患者，可遵医嘱使用生物制剂，如英夫利昔单抗等，也有助于控制疾病;
2、药物治疗：克罗恩病患者需遵医嘱使用氨基水杨酸制剂、糖皮质激素等药物控制疾病活动，预防并发症的发生，常用药物有美沙拉肽肠溶片、布地奈德缓释片、氢化可的松片等。另外，克罗恩病患者在使用药物治疗的同时，还要注意补充营养，维持水、电解质平衡，并给予患者适当的营养支持，有助于缓解病情;
3、内镜治疗：在药物治疗效果不佳的情况下，可遵医嘱进行内镜治疗，如内镜下行糖皮质激素注射，或者回肠末端黏膜切除术等，有助于控制疾病;
4、手术治疗：如果克罗恩病发生急性穿孔、慢性穿透性溃疡，或者肠梗阻等，可能需要遵医嘱进行外科手术治疗，切除病变部位。
除上述治疗方法外，克罗恩病患者还要保持良好的心理状态，注意饮食卫生，规律饮食，避免暴饮暴食和过度节食，可以少食多餐。建议吃清淡、易消化的食物，如米粥、面条等，避免吃生冷、辛辣、刺激的食物，如冷饮、辣椒、芥末等，有助于身体恢复。