肛瘘术后大便发黑发绿可能是由于术后饮食调整引起的铁质食物摄入增加，也可能与药物副作用、术后感染或其他并发疾病如胃炎等有关。

1. 铁质食物摄入增加：术后饮食调整可能会增加铁质食物的摄入量，如菠菜、动物肝脏等，这些食物中的铁元素在肠道中被细菌分解后会产生黑色素，进而导致大便变黑。

2. 药物副作用：某些药物如非甾体抗炎药可引起上消化道黏膜损伤，导致出血，使大便呈现黑色；此外，口服含铁制剂也会使大便变黑。

3. 术后感染：肛瘘术后的局部炎症反应和组织修复过程可能导致微血管破裂出血，若未及时处理，会引起轻度出血，导致大便颜色改变。

4. 其他并发疾病：如胃炎等，会导致胃黏膜受损，引起出血，当血液经过消化液的作用后，血红蛋白中的铁元素会释放出来，使大便呈现黑色。对于持续存在上述症状的患者，建议进行电子结肠镜检查以排除其他潜在病因。

如果患者还伴有腹痛、发热等症状，则可能提示术后并发症的发生，需立即就医。

在治疗肛瘘的过程中，患者应注意保持良好的排便习惯，避免便秘或腹泻，以免加重病情。同时，应遵循医嘱合理饮食，避免食用辛辣刺激性食物，以减少对肛门区域的刺激。