自然流产伴有卵巢囊肿增大时，可以考虑腹腔镜手术、中药调理、孕激素治疗、针灸疗法等方法进行治疗。如果囊肿持续增大或伴有不适症状，建议及时就医以评估是否需要手术治疗。

1.腹腔镜手术

腹腔镜手术是一种微创手术，在医生指导下通过小切口进入盆腔内直接观察、诊断和处理卵巢囊肿。此方法适合于较大的卵巢囊肿导致的自然流产并发症。

2.中药调理

中医认为自然流产后卵巢囊肿可能与气血失调有关，可通过中药调理来改善症状。如遵医嘱使用当归、川芎等中药材。适用于轻度至中度的卵巢囊肿，并伴随有气滞血瘀等症状。

3.孕激素治疗

孕激素可以促进子宫内膜生长，减少子宫收缩，从而起到保胎的作用。常用孕激素类药物包括黄体酮胶囊、地屈孕酮片等。对于存在黄体功能不足引起的先兆流产合并卵巢囊肿者有一定的效果。

4.针灸疗法

针灸可调节内分泌系统，缓解卵巢囊肿引起的不适症状。选择三阴交穴、足三里穴等穴位进行针刺。对于某些类型的轻微卵巢囊肿患者可能存在一定的辅助作用。

在考虑接受任何治疗前，应确保囊肿性质为良性且无恶性转化风险。建议定期复查以监测囊肿大小变化，必要时及时就医，以免延误病情。