肛门灌肠一般不会引起疼痛。

肛门灌肠时使用的液体通常是温热的生理盐水或者含有药物的溶液，这些液体可以软化大便、促进排便，同时具有一定的局部麻醉作用，因此并不会导致明显的疼痛感。如果患者感觉到疼痛，可能是由于操作不当引起的局部损伤所致，需要及时告知医生进行处理。

若在灌肠过程中出现剧烈腹痛、腹泻等不适症状，则可能与疾病本身有关，也可能与灌肠操作不当或存在个体差异等因素有关。

在进行肛门灌肠前应确保肠道清洁，并按医嘱使用润滑剂以减少不适感；对于有特殊疾病的患者，在灌肠前后需注意观察病情变化以防意外发生。