做完肛瘘手术后，由于术后疼痛、感染等原因，会导致肛门括约肌痉挛，进而影响排便控制能力，表现为大便擦不干净。

肛瘘手术后，局部组织处于修复状态，炎症反应会刺激肛门括约肌，使其处于紧张收缩状态。这种情况下，即使有少量的大便排出，也会因为括约肌的痉挛而难以完全排出，因此会出现大便擦不干净的感觉。此外，如果术后存在感染，炎症因子进一步加重括约肌的痉挛，也会影响排便控制，导致上述症状的发生。

患者还可能出现肛门疼痛、瘙痒等症状，可能与术后伤口未愈合有关。

术后患者应保持良好的个人卫生习惯，避免使用过硬的厕纸擦拭肛门，以免摩擦伤口，加剧不适感。