生理性卵巢囊肿多发生在月经周期中的某一阶段，具体时间取决于囊肿大小和月经周期。月经期间，激素水平的变化可能对囊肿产生影响，导致其大小和持续时间发生变化。

生理性卵巢囊肿是卵巢组织自然发生的液体填充结构，通常在月经周期中出现。生理性卵巢囊肿通常在月经周期的不同时期出现，如排

卵期或黄体期，一般为3-5厘米，不会引起症状，通常会随着月经周期自行消失。然而，对于一些患有内分泌紊乱、多囊卵巢综合征等疾病的人群，由于体内激素水平的异常，可能会导致囊肿持续存在或增大，甚至出现囊肿破裂、扭转等并发症。

建议定期进行妇科检查，特别是对于有家族史或既往病史的人群，以早期发现和处理可能的健康问题。