肩膀后面有两个窝可能是由肩胛骨畸形、肌性斜颈、佝偻病、类风湿关节炎等病因引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.肩胛骨畸形

肩胛骨畸形是指肩胛骨的位置、大小或形状发生异常改变，导致局部出现凹陷或突出的情况。这可能会影响周围软组织的功能和血液循环，进而引起疼痛。针对此类病症，患者可考虑进行矫形手术来纠正异常结构，如肩胛骨切除术或肩胛骨内固定术。

2.肌性斜颈

肌性斜颈是由于一侧颈部肌肉过度收缩或纤维化所致，当病变侧胸锁乳突肌持续挛缩时，会导致斜方肌附着处隆起并伴有压痛，形成明显的肿块，即“富贵包”。对于此病，物理疗法是最常见的治疗方法，包括按摩、牵引等，通过放松紧张的肌肉来缓解斜颈症状。

3.佝偻病

佝偻病是由维生素D缺乏引起的骨骼发育障碍性疾病，在生长旺盛时期未及时补充维生素D，导致钙磷代谢紊乱，影响骨骼正常生长，表现为肋骨外翻、鸡胸等，因此会出现肩膀后两侧有明显凹陷的现象。患者可通过遵医嘱服用维生素D滴剂、维生素AD胶丸等药物来进行补钙治疗。

4.类风湿关节炎

类风湿关节炎是一种慢性自身免疫性疾病，主要侵犯双手腕关节、掌指关节、近端指间关节等小关节，炎症因子刺激下，会引起关节囊增厚、韧带松弛，从而导致关节畸形，使肩胛骨活动受限，继而出现两个凹陷的症状。患者可以遵照医生的意见使用非甾体抗炎药进行止痛治疗，比如布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊等。

建议定期进行肩部功能锻炼，以维持肩关节灵活性，同时注意营养均衡，避免长时间保持一个姿势不动。必要时，可到医院进行X线检查、磁共振成像等，以便进一步评估肩胛骨形态和关节状况。