急性咽炎是由细菌感染引起的咽部黏膜炎症，而疱疹性咽峡炎则由病毒感染导致，主要累及咽部和软腭。

急性咽炎多为链球菌等革兰氏阳性菌感染引起，这些微生物会释放毒素刺激咽喉部位。疱疹性咽峡炎则是由于柯萨奇病毒A型等肠道病毒入侵所致，病毒在局部复制可引发免疫反应，导致出现水泡样病变。急性咽炎常表现为咽干、咽痛、吞咽困难等症状，严重时还可能伴随发热。疱疹性咽峡炎通常会出现咽痛、咽部充血、口腔内有小疱疹或溃疡等症状，同时还会伴有食欲减退、呕吐等消化道症状。

针对急性咽炎，医生可能会建议进行咽拭子培养以鉴定致病菌类型。对于疱疹性咽峡炎，则需通过咽拭子检测来确认是否存在柯萨奇病毒或其他相关病原体。两种疾病的治疗方法有所不同。急性咽炎通常采用抗生素治疗，如青霉素类或头孢菌素类药物；疱疹性咽峡炎则需要遵医嘱使用抗病毒药物，例如利巴韦林颗粒、磷酸奥司他韦胶囊等。

患者应保持充足的休息，避免辛辣食物，多饮温水，促进新陈代谢，有利于病情恢复。