小儿肠炎反复发烧可能由病毒性感染、细菌性感染、食物不耐受、消化系统功能紊乱、免疫功能低下等病因引起。治疗需针对具体病因进行，如抗病毒药物、抗生素治疗，同时需注意预防脱水和电解质紊乱。建议及时就医以获得专业指导。

1.病毒性感染

由于病毒感染引起的肠道炎症反应，导致体温调节中枢受损而引起发热。可遵医嘱使用抗病毒药物进行治疗，如利巴韦林颗粒、磷酸奥司他韦胶囊等。

2.细菌性感染

由特定病原体侵入血液循环系统中生长繁殖所造成的局部组织器官破坏，进而出现反复发热的现象。针对细菌性感染所致的小儿肠炎，抗生素是主要治疗方法。例如，医生可能会开具头孢克肟干混悬剂、阿莫西林克拉维酸钾片等药物。

3.食物不耐受

当机体摄入某种食物后不能被正常分解和吸收，会导致身体产生异常免疫反应，从而影响肠道健康，诱发肠炎并伴随反复发热的症状。对于食物不耐受引发的小儿肠炎，应首先确定患儿对哪些食物过敏，然后将其从饮食中剔除。必要时可在医生指导下服用复方嗜酸乳杆菌片、双歧杆菌三联活菌胶囊等益生菌制剂来改善不适现象。

4.消化系统功能紊乱

由于各种原因导致胃肠功能减弱或失调，使食物无法充分消化吸收，进而引发肠炎，此时会出现腹泻、腹痛等症状，严重者还会伴有发热的情况发生。可通过热敷腹部的方式缓解不适症状，还可以顺时针按摩肚子促进气体排出。

5.免疫功能低下

如果患儿存在先天或者后天性的免疫缺陷，容易受到外界病原体入侵，导致肠黏膜损伤，继发炎症反应，出现反复发热的表现。针对免疫功能低下的患者，可以考虑接种疫苗增强抵抗力，比如轮状病毒疫苗、脊髓灰质炎疫苗等。

建议密切监测孩子的体温变化，若持续高烧不退，应及时就医以获得适当的补液和抗生素治疗。日常生活中，家长应注意调整患儿的饮食结构，尽量食用易消化的食物，如小米粥、面条等。