先天性肛门闭锁手术后可能有后遗症。

虽然先天性肛门闭锁的手术旨在纠正消化道结构异常，恢复正常排便功能，但手术本身也可能引起并发症，如感染、瘘管形成等。此外，患者可能存在个体差异，如恢复速度、伤口愈合情况等，也会影响术后是否出现后遗症。

如果患者存在巨结肠或神经发育异常，可

能会导致便秘或其他消化问题，增加后遗症的风险。因为巨结肠影响直肠与乙状结肠之间的神经节细胞数量，导致肠道运动障碍，进而引发便秘等问题。

在考虑先天性肛门闭锁的治疗时，应关注可能出现的后遗症风险，并采取适当的预防措施，以减少后遗症的发生。定期复查以及遵循医嘱进行康复训练是确保良好预后的关键。