儿童扁桃体炎的药物治疗时长因个体差异而异，一般在2-4周。治疗时长主要取决于感染严重程度和患儿免疫状态。

扁桃体炎是由病毒或细菌感染引起的扁桃体炎症，通常需要药物治疗。对于急性扁桃体炎，若患儿免疫状态良好，感染症状轻微，且及时发现并治疗，通常可在2周内痊愈。

对于慢性扁桃体炎，由于反复发作，可能导致免疫系统受损，此时治疗时间可能较长，可能需要4周或更长时间。

在治疗儿童扁桃体炎期间，家长应注意观察患儿病情变化，及时复诊，以确保治疗效果和减少并发症风险。