HPV检查感觉疼，可能是因为医护人员操作不当，或者患者本身存在疾病，如宫颈糜烂、宫颈炎等原因导致，建议患者及时告知医生，在医生的指导下进行针对性处理。

1、医护人员操作不当：HPV检查一般是用软的毛刷在宫颈口旋转几圈之后取出进行化验，如果医护人员操作不当，在碰到宫颈组织时造成了一定的刺激，可能会导致检查时感觉疼。

2、宫颈糜烂：如果女性本身存在宫颈糜烂，在做HPV检查时，医生在刷取宫颈脱落的细胞时，触碰到了糜烂的宫颈组织，也会导致HPV检查感觉疼的现象。

3、宫颈炎：女性本身存在宫颈炎时，在做HPV检查时，医生在刷取宫颈脱落的细胞时，会触碰到炎症部位，也会导致HPV检查感觉疼的现象。

4、其他情况：除上述情况外，若患者存在宫颈息肉、宫颈癌前病变、宫颈癌等疾病，都可能会导致局部组织比较脆弱，在做HPV检查时，由于器械的刺激，可能会造成局部比较严重的疼痛感，此时需要针对原发疾病进行治疗，例如存在宫颈息肉的患者，可遵医嘱使用息肉摘除术等进行治疗。

建议女性做HPV检查时保持心情放松，避免过度紧张、焦虑，在做检查前24小时内避免阴道冲洗，也避免进行性生活。如果女性出现阴道分泌物增多、阴道出血等情况，应及时到医院妇科就诊，完善血常规、白带检查等。