在医生指导下合理使用鼻窦炎药物通常不会损伤肝肾功能。

针对鼻窦炎的常用药物如阿莫西林、头孢菌素等抗生素类以及伪麻黄碱等抗组胺药物，其主要作用于感染性病变及缓解黏膜水肿。这些药物通过规范途径摄入后，经过肝脏代谢，但并不会直接伤害肝脏；然后经过肾脏过滤排出体外，并未对肾脏产生额外压力，因此不会引起明显的肝肾功能损伤。但是，在不恰当使用或过量使用时，可能会出现头晕、恶心呕吐等不适症状，此时应及时停药并向医生咨询。

长期服用非处方止痛药或滥用抗生素可能导致肝肾负担增加，从而影响肝肾功能。

患者在治疗鼻窦炎期间应定期监测肝肾功能，确保用药安全有效。同时注意观察身体变化，若发现异常应及时就医。