绍兴市人民医院、绍兴市中医院、绍兴市第二医院、绍兴市第三医院、绍兴市第六医院是绍兴市的男科专科医院，由于每家医院的设备、技术、专家、服务等方面存在差异，因此无法直接判断哪一家医院比较好，建议患者结合自身情况和需求选择合适的医院就诊。

1.绍兴市人民医院

绍兴市人民医院是当地一所综合性的大型医疗机构，对于男科疾病的诊治具有丰富的经验。该医院专注于泌尿外科、男科等领域的研究与诊疗工作，在当地的医疗行业中享有较高的声誉。

2.绍兴市中医院

绍兴市中医院是一所集医疗、教学、科研于一体的综合性中医医院，设有专门的男科门诊，为患者提供专业的中医诊疗服务。医院秉承“以病人为中心”的理念，致力于传承和发展中医药文化，为患者提供优质、高效的医疗服务。

3.绍兴市第二医院

绍兴市第二医院是一家三级甲等综合性医院，拥有先进的设备和技术力量雄厚的医疗团队，能够为男性患者提供全面的诊疗服务。医院注重学科建设，男科作为其重点科室之一，拥有一批经验丰富的专家和专业技术人员，能够开展各类男科手术及微创治疗。

4.绍兴市第三医院

绍兴市第三医院是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，设有独立的男科门诊，可满足患者的就医需求。医院引进了国内外先进的诊疗技术和设备，同时不断加强人才队伍建设，打造了一支技术精湛、服务优良的医疗团队，确保了男科疾病得到及时有效的诊治。

5.绍兴市第六医院

绍兴市第六医院是一所三级乙等综合性医院，设有男科门诊，可以为患者提供专业的诊断和治疗服务。医院拥有一支经验丰富的男科医生队伍，他们熟练掌握各种常见和复杂的男科疾病的诊断和治疗方法，能够为患者提供个性化的治疗方案。

选择合适的医院进行男科疾病诊治时，应考虑个人的具体病情以及医院的专业水平和口碑。同时，建议定期进行体检，以便早期发现和处理潜在的健康问题。