畸形精子是否影响胎儿智商，需要根据引起畸形精子的原因进行分析，常见原因有染色体异常、内分泌异常、生活习惯异常、环境因素等。
1、染色体异常：如果精子畸形率比较高，可能会影响到精子的质量，从而间接影响到胎儿智商。建议男性在备孕期间，避免抽烟、喝酒，尽量少接触化学物品，并且在孕前做全面的检查，必要时可以通过人工受精的方法解决问题;
2、内分泌异常：如果女性在怀孕期间出现内分泌异常，比如缺乏黄体酮和孕激素，或者出现甲状腺功能异常等，都可能会对胎儿的发育造成一定影响，从而间接影响到胎儿智商，甚至导致胎儿智商下降。女性要注意补充充足的营养，并且要在孕期做好各项排畸检查;
3、生活习惯异常：如果男性在日常生活中经常熬夜、吸烟、喝酒，以及作息不规律等，可能会导致精子的质量和数量受到影响，还可能会导致精子畸形率增高。建议男性在备孕期间改正不良的生活习惯，可以适当进行体育锻炼，并且要规律作息;
4、环境因素：如果男性长期处于污染环境中，或者经常接触到放射性物质，可能会导致精子的畸形率增高，从而间接影响到胎儿智商。建议男性在孕期避免接触有毒有害的环境，并且要避免吸烟、喝酒，同时要注意作息规律。
正常情况下，精子的畸形率不高于96%，如果检查出现畸形率过高的情况，要及时查明原因并进行处理，否则会降低胎儿智商。
