疏通完输卵管后一侧疼可能是术后并发症如感染所致。

输卵管疏通术是一种有创性操作，会在一定程度上破坏输卵管黏膜完整性，增加细菌入侵风险。若术后未严格遵守医嘱进行抗生素治疗或个人卫生习惯不佳，则可能导致术后感染发生。感染会引发局部炎症反应，从而产生疼痛症状，并伴随发热、阴道分泌物增多等临床表现。

此外，如果患者在手术过程中受到外力压迫或牵拉输卵管，也可能导致术后出现轻微的不适感，但通常随着时间推移而逐渐缓解。

建议密切观察疼痛变化情况，同时还要注意休息，避免剧烈运动，以免影响身体恢复。