产后三个月出现褐色分泌物可能是激素水平变化引起的子宫内膜炎、子宫内膜异位症、子宫肌瘤、宫颈息肉、剖宫产切口愈合不良等病因导致的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便进行相关检查和治疗。

1.激素水平变化引起的子宫内膜炎

激素水平变化引起子宫内膜炎时，会导致子宫内膜组织炎症反应和水肿，进而出现褐色分泌物。这是由于高水平的雌激素刺激子宫内膜增生，而孕酮则有助于维持子宫内膜稳定。

针对此病因，可以考虑使用抗生素治疗，如头孢菌素类、青霉素等药物进行抗感染治疗。

2.子宫内膜异位症

子宫内膜异位症是指子宫内膜细胞在子宫外生长，导致周期性出血和炎症反应。这可能导致不规则的阴道出血，包括褐色分泌物。对于子宫内膜异位症，可遵医嘱服用非甾体抗炎药如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等缓解疼痛，还可通过手术切除病变组织的方式进行治疗。

3.子宫肌瘤

子宫肌瘤是子宫平滑肌细胞异常增生形成的肿瘤，当其体积增大压迫周围组织时，可能会导致子宫壁血管破裂，从而引起褐色分泌物。这是由于肌瘤组织压迫周围血管所致。如果确诊为子宫肌瘤，可通过手术切除的方式进行治疗，如子宫肌瘤剔除术、子宫动脉栓塞术等。

4.宫颈息肉

宫颈息肉通常由慢性炎症长期刺激形成良性赘生物，若息肉发生坏死脱落，则会引起少量出血，表现为褐色分泌物。这是由于息肉表面毛细血管破裂所致。针对宫颈息肉，可在医生指导下采用激光疗法、冷冻疗法等方式进行处理。

5.剖宫产切口愈合不良

剖宫产切口愈合不良可能是因为个体差异、术后护理不当等原因导致切口处血液循环受阻，影响了正常的修复过程，使伤口难以愈合，容易出现渗血现象，表现为褐色分泌物。针对这种情况，可以在医生的指导下使用促进伤口愈合的药物进行治疗，比如重组人表皮生长因子凝胶、红霉素软膏等药物局部涂抹。

建议患者定期复查妇科超声以及宫颈涂片检查，以监测任何潜在的问题。必要时，应保持良好的个人卫生习惯，避免过度劳累和精神压力，以免影响身体恢复。