降低男性精子畸形率，通常需要根据病因进行具体分析，导致男性精子畸形率增高的常见原因包括不良生活习惯、疾病因素、遗传因素，以及进行适当的运动等。

1、不良生活习惯：例如经常熬夜、吸烟、饮酒，或者长期接触化学物质等，其中烟中的尼古丁、烟油中的有害物质，会影响精子的质量，造成精子畸形率增高。此时建议尽量避免熬夜，以及吸烟和喝酒，同时尽量在空气清新的环境中生活，避免处于污染的环境中，还可适当进行运动锻炼，如慢跑、打羽毛球等，同时保持良好的心态，一般能够在一定程度上改善精子畸形率;

2、疾病因素：如前列腺炎、精囊炎、睾丸炎等，通常由于炎症的刺激，可能导致精液中出现白细胞、巨噬细胞等，进而破坏精子形态，导致精子畸形率增高。此时可遵医嘱应用抗菌药物进行治疗，如罗红霉素胶囊、阿莫西林胶囊等;

3、遗传因素：如染色体异常、家族遗传等，其中染色体异常一般是指染色体出现异型或者碎片率增高，也可能导致精子畸形率增高。建议男性适当进行体育锻炼，并保持良好的作息习惯，尽量不要染色体异常，或者进行遗传咨询;

4、进行适当的运动：通常男性经常进行游泳、慢跑等有氧运动，可以提高身体素质，并且能够提高精子质量，进而降低精子畸形率。

因此降低男性精子畸形率，需要明确导致精子畸形率增高的原因，并且进行针对性治疗。另外在日常生活中，建议男性保持私处卫生，并且尽量穿棉质内裤，避免穿过紧的裤子。