食管闭锁伴有气管食管瘘的患者会发生反流性食管炎。

因为食管闭锁致使食物无法顺利通过，当食物残留在闭锁部位周围时，可能会逆流入气管，引发炎症反应，即反流性食管炎。此病症可能伴随呕吐、体重减轻及生长迟缓等症状。

此外，由于胃酸分泌增加，长期存在气管食管瘘会导致肺部感染的发生概率增高，引起咳嗽、咳痰等呼吸道症状，甚至可能导致呼吸困难。

对于食管闭锁伴有气管食管瘘的患者，重点是维持良好的营养状态，避免使用促进胃肠动力的药物以减少食物进入气管的风险。定期复查评估病情变化也是必要的。