阴囊毛囊处的小疙瘩伴有疼痛可能是毛囊炎、附睾炎、尖锐湿疣等原因导致的，需要针对具体病因进行处理。
1.毛囊炎：由于金黄色葡萄球菌等病原体侵袭毛囊所致，可出现红色丘疹、脓疱等典型表现，常伴疼痛和触痛。遵医嘱涂抹夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏等抗生素药膏是可行的治疗方法。
2.附睾炎：多由细菌逆行感染引起，通常表现为附睾肿胀、疼痛等症状，严重者可能出现发热、乏力等全身症状。患者可在医生指导下服用阿奇霉素片、盐酸左氧氟沙星胶囊等抗感染药物进行治疗。
3.尖锐湿疣：主要是人乳头瘤病毒感染引起的，典型症状为生殖器周围出现单个或多个小颗粒，有时伴有轻微疼痛或瘙痒。对于尖锐湿疣，通常需采用物理疗法如冷冻、激光去除病变组织，并结合抗病毒药物如咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏外用以增强疗效。
如果疙瘩持续存在或疼痛加剧，应尽快就医以便获得准确诊断和适当治疗。在确诊前应避免擅自挤压或搔抓受累区域，以防加重炎症或造成感染扩散。
除上述原因外，还可能与皮脂腺囊肿继发感染有关。此时不建议自行处理，以免加重病情，需及时就医。
针对阴囊部位出现疑似皮肤问题的症状，应避免过度焦虑，保持局部清洁干燥，同时注意个人卫生，避免紧身衣物摩擦刺激患处。
