怀孕5周小便后刺痛可能是尿路感染引起的。

怀孕期间，体内激素水平发生变化，会使得阴道分泌物增多，如果不注意个人卫生，可能会增加细菌感染的风险，从而引发尿路感染。此外，增大的子宫会对膀胱产生一定的压迫作用，使排尿次数增多，但每次排尿量减少，这也会增加尿液滞留的时间，有利于细菌繁殖，进而诱发尿路感染。

如果症状持续或伴有发热、腰痛等症状，则可能为急性肾盂肾炎，需及时就医诊治。

孕期女性应特别关注泌尿系统的变化，保持良好的个人卫生习惯，避免长时间憋尿，以减少尿路感染的发生风险。